雄株は境内仁王門側にあり、樹高13.3m、根廻り4.64m。雌株は境内薬師堂側にあり、樹高15.9m、根廻り5.02m。いずれの株も高さ2m以下のところから幹が分岐している。
　ビャクシンはヒノキ科ビャクシン属の常緑高～低木で、日光不足に弱いため海岸近くの環境が適している。自生のものは岩手県以南から九州の主に太平洋側に分布している。樹皮は灰褐色で、果実は球形。開花した翌年の秋に直径6～8mmの紛白をおびた紫黒色の毬果が成熟する。「ふくしまレッドリスト」（2022年版）では、準絶滅危惧に指定されている。
　このビャクシンはどちらも剪定は行われておらず、自然樹形。害虫などによる被害も見られず、生育は概ね良好である。ただし、雌株には落雷の痕跡があり、枝の一部が枯死している。樹齢は、寸法が近い同種の例から考えると、500年以上と推定される。薬師堂が文明年間(1469～1487)の造営とされているので、それ以降に植えられた可能性がある。
　福島県内では元々まれな樹種であり、現存するビャクシンの中では、最も大きな巨樹である。近くにはビャクシンが自生している場所があり、このビャクシンもそこに由来すると考えられる。郷土樹種の遺伝子資源として貴重である。